Я, конечно, тоже не супер-пупер знаток школ российских, ибо преподаю в заповеднике, но, как мне кажется, есть еще и вот какая глобальная проблема.
Эволюцию изучают, согласно программе, в 11 классе. Не то, чтобы до этого ничего об эволюции не говорили (в конце концов, очень неудобно преподавать зоологию и ботанику, не упоминая хотя бы факта преемственности организмов), но на механизмах там особо не останавливаются.
В итоге мы имеем то, что одиннадцатиклассники приходят с уже во многом сформировавшимися представлениями о том, как эволюция протекает. И, как вы понимаете, в основном это отнюдь не результат систематического самообразования (пацаны на улице рассказали, ага)- так что в головах может поселиться всякое. И вот переубедить учеников уже становится трудно, ибо та же программа заточена на первичное убеждение, а не на переубеждение.
В чем-то эта проблема есть и на биофака, где ТЭ преподается только на четвертом курсе.
Причина такого позднего изучения эволюции мне понятна - для адекватного изложения эволюционной биологии надо знать кучу всего иного: генетику, экологию, эмбриологию, да тот же теорвер etc.
Решение я вижу в "концентрической" системе, когда вначале какие-то базовые, концептуальные вещи объясняются чуть ли не на пальцах, а потом, в 11 классе (или на четвертом курсе), это уже изучается углубленно.